嘉兴南湖实验教育集团万兴校区位于南湖区基金小镇，东至南江路，南至万兴路，西至庆丰路，北至合作桥港。学校总用地60720㎡，总建筑面积55409.05㎡，其中地上面积40189.7㎡，地下面积15219.35㎡。学校设施齐全，配备有400米标准跑道运动场、可容纳500人的报告厅以及60间普通教室，同时拥有5层专用教室以满足不同教学需求。此外，地下停车场可提供350个停车位，有效实现人车分流，保障校园安全，提供便捷的接送环境。

万兴校区将始终坚守集团“助力每一位孩子健康成长”的核心理念，秉承“阅读像呼吸一样自然”、“运动像吃饭一样规律”、“小习惯成就大未来”、“家长是学校教育最可依靠的力量”、“只有促进教师的发展，才能更好促进学生的发展”等教育信条，致力于将学校打造成为孩子们快乐成长的书香校园、童玩乐园与温馨家园，为孩子们提供全面、优质的教育环境，助力学生茁壮成长。

万兴校区将实施从小学至初中的九年一贯制教育模式，并于2024年秋季学期正式启动招生工作，共次招生对象为一年级和七年级学生，各招收一个班级。嘉兴南湖实验学校教育集团槜李校区因扩建，借用万兴校区就读，小学12个班级和初中一个班级。